Nació el 22 de diciembre 1806 en Bamberg, Alemania, hijo de Christian Pfeufer, médico y ex profesor de medicina en la Universidad de Bamberg. Estudió en Erlangen y Würzburg, y luego se convirtió en ayudante de Johann Lukas Schönlein. En 1840 ya era profesor y director de la clínica de medicina interna en Zurich, y en 1844 tuvo a Theodor Bischoff como profesor de instrucción farmacéutica en Heidelberg. En 1852 se convirtió en profesor clínico en Munich.
